为惠及更多地区，方案还设计了三条主要支线
通向延安方向的“红延河”，通向内蒙古、北京方向的“漠北河”，以及通向吐哈盆地的“春风河”。
“红旗河”的三条主要支线均是基于相关区域地理特点的最优选择，使得在保证坡降的前提下，能够全程高水位自流，保持高水位优势，有能力将水源和水能送往更多的干旱区域。
红延河。从甘肃省定西市通渭县境内开始（水位1791米），向东北穿过六盘山到达固原（水位1710米），接着向北延伸至同心县境内（水位1645米），再沿白于山北坡至榆林市定边县境内（水位1500米），最后经多条短隧洞进入延河（水位1440米），总里程488公里，平均坡降万分之7.2。
由于全程保持高水位运行，可自流惠及六盘山、白于山以北，黄河以南的绝大部分区域，弥补了由于黄河水位过低导致的宁夏南部、鄂尔多斯高原和陕西北部干旱问题。
全程高水位运行，坡降大于万分之2.15，可以“自流”惠及沿线北侧的所有地区。
春风河。从玉门市境内开始（水位1550米），绕北山西侧延伸至吐哈盆地（水位1180米），全程坡降大于万分之2.7。
保持高水位运行，一方面可以自流惠及大部分区域，另一方面也可以根据需求继续向北疆延伸。从起始位置至疏勒河河谷的26公里，高差达160米，坡降万分之61.5，适合开发水电控制流速。
2018年1月，红旗河西部调水课题第二次专家研讨会在北京举行，专家们这一方案的重点、难点进行了深入探讨。
来自国内方方面面的专家都参与了这次会议，包括中科院、中国水利水电科学研究院、黄河水利委员会、长江水利委员会、南水北调总公司以及清华、北大等多家单位相关领域的专家、教授。
会议就工程地质、地震、施工能力、工程设计、生态环境、水资源配置、经济效益等问题进行了深入的探讨。
认为，工程的关键在于地质。通过对活动断裂、地质构造等问题的具体分析，研究了工程的重点区段，评估了处理方法和对策。
总体认为，“红旗河”西部调水方案意义重大，且没有不可逾越的难点，值得不断推进和深化。
本次会议对“红旗河”西部调水后期的具体设计将起到重要指导作用。
#p#副标题#e#
参加会议的五位院士均发表了自己的看法
中国工程院院士、中国水利水电科学研究院水资源所名誉所长、水文与水资源学家、流域规划专家王浩认为：“红旗河”方案设计巧妙，是一个全新思路，是切实可行的方案，没有太大的技术障碍，具有十分重要的意义。我国正处于一个大有可为的历史机遇期，有信心、有能力完成这样的工程。
中国工程院院士、水工结构抗震专家陈厚群认为：“红旗河”方案的设计非常好，以现有的技术条件实施是没有问题的，意义重大。
线路经过的一二级阶地过渡带地质条件复杂，通过对一些具体线路的隧洞或大坝工程进行创新设计，多做预案，能够从单体工程和系统工程两方面降低“断裂”带来的风险。
希望以科学、严谨、周密的作风为“红旗河”方案的研究多做工作，为新时代的水利事业做出自己的贡献。
中国科学院院士、中国科学院地质与地球物理研究所研究员、地球物理学和地球动力学专家滕吉文认为：“红旗河”方案意义重大，线路设计非常巧妙，边界条件非常好。
沿线复杂的地质和构造问题确实是工程的难点，但总的来说都有应对方法。
我们不能畏首畏尾、彷徨懈怠，要扎实研究、勇于创新、突破难点，积极推进“红旗河”方案，为我国的生态建设、粮食安全、经济发展做出贡献。
